肉制品中致泻大肠埃希菌的分子特征分析

目的 了解国内肉制品中致泻大肠埃希菌(DEC)的流行特征.方法 运用全基因组测序技术对86株DEC进行分子特征分析,明确优势病理类型、序列型和血清型.通过全基因组单核苷酸多态性分析,确定我国肉制品来源DEC菌株之间的系统发育关系.结果 肉制品中致泻大肠埃希菌的病理类型以EAEC为主,86株DEC可分为8种毒力基因型,包括48个ST型(包括6个新ST型)和55个O∶H血清型;ST11和CC10为优势序列型和克隆复合体,O157、O15和O6为优势血清群.DEC菌株间表现为高度的遗传异质性,相同病理类型的同源性较低,处在不同的进化分支上.结论 DEC的病理类型与ST型及血清型间未见对应关系,通过对ST型及血清型的监测不能直接对病理类型进行判断,但数量最多的ST型及血清型揭示了 DEC的主要危害特征与防控点.可根据全基因组测序结果补充和优化DEC的判定方法,为今后DEC的溯源及流行病学调查提供数据支撑.