Crop phenology reshapes the food-safety landscape for roe deer in an agroecosystem

Understanding the behavioural adjustments of wildlife in anthropized landscapes is key for promoting sustainable human-wildlife coexistence. Little is known, however, about how synanthropic species navigate spatio-temporal variation in the availability of food and cover that are shaped by human practices such as agriculture.Animal habitat use is predominantly driven by spatial and temporal variations in food and cover, as individuals respond to fluctuations in the trade-off between food acquisition and risk avoidance. In agroecosystems, the availability of high-quality forage and cover is dependent on agricultural practices (e.g., harvesting) and crop phenology, providing an ideal opportunity to evaluate how wildlife adjust their behaviour in a heterogeneous human-dominated landscape.We investigated the influence of crop phenology on the behaviour of European roe deer (Capreolus capreolus) to infer the functional roles of crop types in the food-cover landscape. We analysed the habitat selection and activity patterns of 105 GPS-collared adult female roe deer using a unique data set combining field-specific land cover data, region-specific estimates of crop phenology and weekly harvesting data for three common crops in a French agroecosystem.We found very distinct habitat selection and activity patterns according to crop type, phenological stage and time of day. Wheat and artificial meadows were strongly selected at night-time during the early and post-harvest stages only, when roe deer were highly active, suggestive of feeding activity. On the contrary, roe deer strongly selected maize during the day when it was high enough to provide cover, when they were less active, indicating that it was primarily used for refuge. These patterns depended on the availability of more 'natural' cover, suggesting that mature maize may substitute for 'natural' cover when the latter is scarce.Synthesis and application: Our work highlights the importance of behavioural plasticity and habitat complementation in the persistence of this synanthropic species in agroecosystems. This behavioural adjustment may buffer the consequences of the reduction in natural habitats that accompanies intensification of agricultural production and has implications for understanding how agricultural practices shape the food-safety trade-off of wildlife living in these highly modified landscapes. Penser une coexistence durable entre humains et non-humains necessite une meilleure comprehension des ajustements comportementaux de la faune sauvage aux dynamiques des paysages anthropises. Peu d'etudes ont neanmoins considere comment la faune sauvage repond aux variations spatio-temporelles des ressources alimentaires et d'habitats refuge qui sont tributaires des pratiques humaines, comme l'agriculture.L'utilisation de l'espace par les animaux est principalement sous-tendue par les variations spatiales et temporelles en nourriture et en couvert, les individus repondant aux fluctuations du compromis entre l'acquisition des ressources et l'evitement du risque. Au sein des agroecosystemes, la disponibilite en ressources alimentaires de haute qualite et en couvert vegetal depend de la phenologie des cultures agricoles et des pratiques agricoles (ex: la recolte), ce qui en font des systemes ideaux pour evaluer les ajustements comportementaux de la faune sauvage a des paysages heterogenes, faconnes par l'activite humaine.Nous avons ainsi etudie l'influence de la phenologie des cultures agricoles sur le comportement du chevreuil d'Europe (Capreolus capreolus) afin d'inferer les roles fonctionnels, en tant que ressource et/ou couvert, pour chaque type de culture agricole. Nous avons analyse la selection d'habitat et les patrons d'activite de 105 chevreuils femelles adultes, equipes de colliers GPS, dans un agroecosysteme francais. Pour ce faire, nous avons utilise un jeu de donnees unique associant des donnees d'assolement a haute resolution, des estimations regionales de la phenologie des cultures et des releves hebdomadaires des fauches/recoltes de parcelles pour trois cultures agricoles communes.Nous avons trouve des patrons d'activite et de selection d'habitat tres differents selon le type de culture agricole, son stade phenologique et le moment de la journee (nuit/jour). Le ble et les prairies artificielles etaient selectionnees fortement de nuit, quand les chevreuils etaient actifs, et seulement pendant l'emergence des cultures et apres leur recolte, suggerant un comportement d'alimentation. Au contraire, le mais etait selectionne de jour, quand les chevreuils etaient peu actifs et quand le mais etait assez haut pour fournir du couvert vegetal; ceci suggere que les chevreuils utilisaient le mais mature principalement en tant qu'habitat refuge. Ces patrons dependaient neanmoins de la quantite de couvert vegetal plus << naturel >> (bois, haies) disponible au sein du domaine vital de l'individu, suggerant que les chevreuils utilisaient le mais mature comme habitat refuge de substitution, pour pallier le manque d'habitat refuge naturel.Synthese et applications. Notre etude souligne l'importance de la plasticite comportementale et de la complementation paysagere pour expliquer la presence et la persistance de cette espece dans les agroecosystemes. Les ajustements comportementaux des especes synanthropiques semblent pouvoir tamponner les consequences de la reduction des habitats naturels qui accompagnent l'intensification de la production agricole. Cette etude permet de mieux comprendre comment les pratiques agricoles modifient le compromis entre l'acquisition de ressources alimentaires et l'evitement du risque pour la faune sauvage vivant dans les paysages fortement modifies par l'humain. Our work highlights the importance of behavioural plasticity and habitat complementation in the persistence of this synanthropic species in agroecosystems. This behavioural adjustment may buffer the consequences of the reduction in natural habitats that accompanies intensification of agricultural production and has implications for understanding how agricultural practices shape the food-safety trade-off of wildlife living in these highly modified landscapes.image