基于TCGA数据库的一种新型肾透明细胞癌的双硫死亡相关lncRNA预后模型的构建

目的 基于癌症基因图谱(TCGA)数据库,构建肾透明细胞癌(ccRCC)双硫死亡相关的长链非编码RNA(DR-lncRNA)风险预后模型,筛选ccRCC高危人群进行早期干预治疗,以提高患者的生存率,探究该模型对肾癌患者生存预后的预测作用与价值.方法 从TCGA数据库中下载ccRCC、癌旁样本的转录组数据和临床资料.通过文献检索获得双硫死亡相关基因.用Pearson分析鉴定DR-lncRNA,并通过Cox回归分析构建与ccRCC患者预后有关的DR-lncRNA模型.结合临床特征多角度评估模型稳定性和有效性.通过富集分析和免疫浸润分析确定不同风险患者之间免疫微环境差异.实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)实验在 ccRCC患者癌和癌旁组织中验证.结果 基于 7 个与预后显著相关的 DR-lncRNA(AL590822.3、AL355835.1、AC008555.1、SPINT1-AS1、AC106786.1、AC108673.3、AL121944.1)建立的预后模型中高低风险两组明显存在生存差异,1、3、5 年受试者工作特征(ROC)曲线下面积分别为 0.729、0.750、0.772.多因素Cox回归表明,该预后风险模型是ccRCC的独立预后因素.GSEA结果表明,免疫缺陷相关通路在高危人群中被激活.免疫治疗效果分析,低风险组免疫结局较好.在免疫细胞和免疫相关功能中,CD8+T细胞等在高风险组表达增高.qPCR结果证明了模型基因在ccRCC和癌旁组织中差异表达.结论 7 个DR-lncRNA模型可以准确预测ccRCC患者的预后,并可能为临床应用和免疫及靶向治疗提供新见解.