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西南地区六种魔芋属植物基于cpDNA序列的遗传多样性研究

YIN Si,HAO Zhuan, LU Feidong, GAO Yong

Guihaia(2023)

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摘要
研究野生作物资源的遗传变异及分化机制对种质资源的收集与改良具有重要意义.魔芋是我国西南地区的特色经济作物,但由于受到人为活动干扰,野生种群不断衰退.为评估西南地区魔芋属(Amorphophallus)野生群体的遗传多样性,探究代表性物种的系统发育地位,该研究利用 3 个叶绿体DNA(cpDNA)片段,分析了魔芋 6 个物种的遗传多样性,重建了种间系统发育关系.结果表明:(1)西南地区野生魔芋群体的遗传多样性普遍较低,虽然单倍型多样性(Hd)均值为 0.428,但近一半群体只有 1 个单倍型,6 个物种整体水平上的单倍型多样性在0.704~0.983 之间.(2)在6 个物种间检测到高水平的遗传分化,遗传分化系数(FST)值在 0.481~0.967 之间.(3)系统发育分析表明,选取的 27 个魔芋种主要聚成 3 个分支,即非洲分支、东南亚分支和东亚大陆分支.疣柄魔芋(A.paeoniifolius)隶属于东南亚分支,而东亚大陆分支A包含花魔芋(A.konjac)和西盟魔芋(A.krausei),东亚大陆分支 B 由东亚魔芋(A.kiusianus)、滇魔芋(A.yunnanensis)和东京魔芋(A.tonkinensis)构成.生境隔离与人为干扰造成了西南地区野生魔芋群体较低的遗传多样性,魔芋属东亚大陆分支的分化可能与早期的快速扩张和生态适应有关.该研究结果为西南地区魔芋资源的合理保护、可持续利用和杂交育种提供了参考资料.
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关键词
southwest china,amorphophallus,genetic diversity,phylogeny,species conservation
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