青海湖一株野鸟源H5N1亚型禽流感病毒核酸检测及其基因组序列特性分析
Chinese Qighai Journal of Animal and Veterinary Sciences(2023)
摘要
2022年8月,青海省刚察县野鸭出现异常死亡.采集死亡野鸭的组织提取核酸,经禽流感病毒(AIV)M基因引物初步鉴定定样品中含有AIV,随后H5/H7/H9 分型引物鉴定.进一步二代测序后获得了AIV的8 片段基因序列.序列比对分析表明,除了NS基因,其余基因与以往报道或H5 亚型AIV标准毒株的内部基因同源性较高,HA基因裂解位点具有高致病性(HPAI)AIV 的特征,故将感染野鸭的毒株命名为 A/Wigeon/Qinghai/2022(H5N1).从HA基因的遗传进化分析中发现,A/Wigeon/Qinghai/2022(H5N1)与最近几年在野鸟中流行的H5N1和H5N8 同在2.3.4.4b分支,而与2005-2015 年在青海湖地区流行的毒株遗传距离较远,表明青海湖野鸟源H5亚型AIV遗传多样性丰富,需要持续对该地区野鸟中携带的AIV进行监测.
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关键词
Qinghai Lake,Wild bird,H5N1,Sequence analysis
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