半番鸭及番鸭性腺微生物区系差异分析
Chinese Journal of Animal Science(2023)
Abstract
本研究旨在揭示属间杂交品种半番鸭及父本番鸭性腺样本中微生物物种构成和群落结构的差异.分别采集 200 日龄雄性番鸭和半番鸭 3 个性腺组织进行 16S rRNA扩增子测序、物种注释以及丰度分析,并进行菌群代谢功能预测.结果表明:变形菌门(Proteobacteria)为鸭性腺中优势菌群,假单胞菌属(Pseudomonas)为优势菌属,假单胞菌科均为优势菌科,双歧杆菌(Bifidobacterium)和小杆菌属(Dialister)分布存在差异,主要差异为双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)和韦荣菌科(Veillonellaceae).假杆菌(Pseudarthrobacter)、芽生球菌属(Blastococcus)、粘球菌科(Myxococcaceae)、白头翁科(Trueperaceae)、地嗜皮菌科(Geoderm atophilaceae)等下调(P<0.05),即在半番鸭中低表达,毛螺菌属(Lachnospira)、假心菌科(Pseudonocardiaceae)上调(P<0.05),即在半番鸭中高表达,推测乳酸杆菌科(Lactobacillaceae)和奈瑟菌(Neisseria)可能影响鸭性腺发育.KEGG功能注释显示,差异微生物主要参与L-异亮氨酸生物合成I(L-isoleucine biosynthesis I)、L-缬氨酸生物合成(L-valine biosynthesis)和CDP-二酰基甘油生物合成I(CDP-diacylglycerol biosynthesis I)等功能,涉及到多种氨基酸的合成通路.综上所述,鸭性腺中存在微生物群落,其中变形菌门、假单胞菌属、假单胞菌科为优势菌群,半番鸭及其父本番鸭性腺微生物区系存在一定差异,假杆菌、粘球菌科和地嗜皮菌科等在半番鸭中显著低表达,毛螺菌属和假心菌科在半番鸭中显著高表达,乳酸杆菌科(Lactobacillaceae)和奈瑟菌(Neisseria)可能影响鸭性腺发育.
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