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基于RNA测序的益肾养髓方对脊髓型颈椎病大鼠神经保护作用机制研究

LIU Pengqun, YIN He, CHEN Xin, ZHANG Boyu,JIN Zhefeng,ZHU Liguo

Chinese Journal of Information on Traditional Chinese Medicine(2023)

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Abstract
目的 采用RNA测序技术,从基因与分子层面探讨益肾养髓方治疗脊髓型颈椎病的潜在作用机制.方法 30只SD大鼠随机分为假手术组、模型组和中药组,采用脊髓压迫法建立脊髓型颈椎病大鼠模型,中药组于术后1周开始予益肾养髓方灌胃,每日1次,连续8周.采用Basso Beattie Bresnahan(BBB)评分评估大鼠脊髓功能,透射电镜观察脊髓组织病理形态,RNA测序技术筛选各组差异基因并进行生物信息学分析,RT-PCR检测差异基因mRNA表达,Western blot检测差异基因蛋白表达.结果 与假手术组比较,模型组大鼠BBB评分显著降低(P<0.05);与模型组比较,术后4周开始,中药组大鼠BBB评分显著升高(P<0.05).透射电镜观察显示,模型组脊髓组织髓鞘不完整,可见断裂或卷曲,神经元线粒体嵴断裂、缺失;中药组髓鞘结构排列较规则,线粒体形态破坏较轻.RNA测序技术筛选出假手术组与模型组差异基因303个(153个上调、150个下调),模型组与中药组差异基因341个(130个上调、211个下调),对差异表达基因取交集,得到117个共表达基因,显著性排名前3位的基因分别为Gpnmb、cd68、Caspase-1;差异共表达基因GO富集分析显示,生物过程主要涉及免疫、再生、代谢等,细胞组分包括细胞、胞外区、分子复合物等,分子功能包含受体调节活性等;KEGG通路富集分析显示,主要与CREB信号通路、神经活性配体-受体相互作用、PPAR信号通路等显著相关.RT-PCR和Western blot结果显示,与假手术组比较,模型组脊髓组织Gpnmb、cd68、Caspase-1 mRNA和蛋白表达显著升高(P<0.05);与模型组比较,中药组脊髓组织Gpnmb、cd68、Caspase-1 mRNA和蛋白表达显著降低(P<0.05).结论 益肾养髓方可能通过Gpnmb、cd68、Caspase-1等靶点治疗脊髓型颈椎病,涉及神经系统调节、免疫、代谢及反馈调节等诸多生物学过程,并通过CREB信号通路、神经活性配体-受体相互作用、PPAR信号通路等相关通路介导细胞凋亡、焦亡、炎症反应、氧化应激等发挥作用.
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Key words
Yishen Yangsui Prescription,cervical spondylotic myelopathy,RNA-Seq technique,differentially expressed genes,signaling pathway,rats
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