宏基因组二代测序在肺部感染病原诊断中的价值

目的 比较宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)与实验室传统培养在肺部感染病原中诊断的应用价值.方法 回顾性分析2021年2月-2022年9月中部战区总医院收治的310例疑诊肺部感染患者临床资料,分析mNGS与实验室传统培养检测结果,对比2种检测方法检测肺部感染病原的阳性率、灵敏性、特异性、准确性(accuracy,ACC)、阳性预计值(positive predictive value,PPV)、阴性预计值(negative predictive value,NPV).结果 研究发现,mNGS能够同时检出多种病原,对细菌的检出效率最高,对真菌的检出阳性率最低,且mNGS检出的细菌、真菌与病毒的序列数之间有显著差异(H=70.361,P＜0.001).在比较分析mNGS与实验室传统培养方法中发现,mNGS检出阳性率(88.40％)高于实验室传统培养(29.70％),差异有统计学意义(x2=162.373,P＜0.001),检测结果一致性比较 Kappa=-0.003,P=0.902;mNGS 的灵敏性、特异性、ACC、PPV、NPV 分别为 91.29％、28.26％、81.94％、87.96％、36.11％,传统培养分别为30.30％、73.91％、36.77％、86.96％、15.60％;其中,两种方法间的灵敏性和特异性差异有统计学意义(91.29％vs 30.30％,x2=148.120,P＜0.001;28.26％vs 73.91％,x2=13.793,P＜0.001).结论 mNGS能够显著提高肺部感染病原的检出率,是传统实验室培养方法的必要补充,为指导临床抗感染治疗提供有力依据.同时,传统培养与mNGS病原检测方法都高度依赖于标本质量和检测质控,mNGS在提供无损的多种病原遗传信息的同时也需正确解读,才能正确甄别致病原.