Mise au point et évaluation d'un test de diagnostic moléculaire de la bilharziose sur plateforme automatisée

La bilharziose est une maladie tropicale négligée et constitue un problème de santé publique majeur affectant plus de 250 millions de personnes dans le monde. En cause, la présence d'un parasite du genre Schistosoma pouvant persister plusieurs décennies et être responsable de complications à long terme sévères, variables selon l'espèce impliquée, et évitables par un diagnostic et un traitement précoce. Du fait de l'augmentation des flux migratoires, les zones non endémiques dont la France sont de plus en plus concernées et on estime la séroprévalence à plus de 24% chez les sujets originaires d'Afrique sub-saharienne. Or, le diagnostic actuel repose sur un examen microscopique des excreta peu sensible et chronophage, et sur des tests sérologiques non informatifs sur l'espèce en cause et l'évolution de l'infection. Le diagnostic moléculaire s'est récemment révélé plus précoce et plus sensible que les techniques standards dans les excreta, et peut aussi être réalisé sur sérum, mais les multiples étapes requises limitent son implémentation dans les logigrammes diagnostiques. Ce travail visait à développer le diagnostic de la bilharziose par biologie moléculaire automatisée, et à évaluer l'intérêt de la PCR sérique. Nous avons mis au point une PCR en temps réel sur une plateforme intégrée permettant la détection d'ADN de S. hæmatobium (SH) et S. mansoni (SM) à partir des échantillons d'urines, de selles et de sérums. La PCR sérique a été évaluée rétrospectivement sur sérums de patients suspects de bilharziose (N=47) collectés entre 2017 et 2022 et répartis en « Bilharzioses confirmées » lorsque la présence d'oeufs était observée en microscopie dans les selles ou les urines (N=18), ou en « Bilharzioses probables » lorsque seule la sérologie était positive (N=29). Cette technique a permis d'obtenir un résultat pour les trois matrices d'un même patient en une seule série de 1h30, avec un temps de manipulation inférieur à 15 minutes. La PCR sérique était positive chez 78,7% (37/47) des patients suspects de bilharziose, et elle a permis de détecter une infection mixte dans 8,5% (4/47) des cas. S. mansoni a été détecté pour 29,8% (14/47) des patients en PCR contre seulement deux bilharzioses intestinales confirmées par la microscopie. Si 88,9% (16/18) des PCR étaient positives dans le groupe des bilharzioses prouvées, la PCR a confirmé le diagnostic et identifié l'espèce impliquée dans 72,4% (21/29) des bilharzioses probables. L'automatisation simplifie et standardise la PCR et permet d'envisager l'intégration de celle-ci dans le panel diagnostique existant. La PCR sérique présente de bonnes performances et rend possible l'identification de l'espèce – et donc l'orientation des explorations complémentaires – à partir du sérum, parfois plus simple à obtenir que les selles et urines, ou de s'affranchir des failles de l'examen microscopique en termes de défaut de sensibilité ou de variabilité d'excrétion des oeufs. Aucun lien d'intérêt