Intérêt des PCR multiplex virales chez les enfants de 5 ans et moins hospitalisés pour infection des voies respiratoires

Médecine et maladies infectieuses formation(2023)

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摘要
Les infections respiratoires aiguës sont un motif courant de recours au système de soins. En population générale, les symptômes respiratoires fébriles concernent jusqu'à 25% des motifs de consultation aux urgences. Fréquentes en pédiatrie, les infections respiratoires virales représentent 50-70% des infections respiratoires basses. La difficulté de distinction entre étiologies virale et bactérienne est parfois source de prescription d'antibiotiques inutiles. Faciles de réalisation, les PCR Multiplex permettent l‘amplification simultanée sur un prélèvement de plusieurs séquences cibles et la détection de larges panels de pathogènes, viraux et bactériens. Cette étude observationnelle rétrospective monocentrique, faisant suite à la mise en place de PCR multiplex virales, interroge sur leur pertinence chez les patients ≤ 5 ans hospitalisés pour infection respiratoire aiguë. Elle décrit l'impact de cette technique sur la prescription d'une antibiothérapie et le délai de sortie de l'hôpital. Analyse de pratique à partir d'un recueil rétrospectif des données du laboratoire et du dossier patient informatisé des patients ≤ 5 ans hospitalisés en pédiatrie ou aux urgences pour infection respiratoire aiguë entre le 07/11/ 2019 et le 09/01/2022, ayant bénéficié d'une PCR Multiplex respiratoire. PCR Multiplex réalisées: - panel viral 1 (SARS-CoV-2, Influenza A et B, VRS) - panel viral 2 (Adenovirus, Enterovirus, Parainfluenzae 1-2-3-4, Metapneumovirus) - panel viral 3 (Bocavirus, Rhinovirus, Coronavirus NL63, 229E et OC43) - panel bactérien Cette étude concerne les panels viraux 2 et 3 (rendu: 3 jours). Un total de 2635 examens de biologie moléculaire sur prélèvements respiratoires ont été analysés, dont 2315 concernaient des enfants pris en charge lors d'un séjour aux urgences pédiatriques ou en service de pédiatrie. Après exclusion des PCR GeneXpert Covid (n=68) et des examens annulés par le laboratoire (n=38), les résultats de 2209 PCR Multiplex respiratoires étaient disponibles, dont 459 concernaient les panels 2 (n=231) et 3 (n=228). Quarante-huit (20,8 %) PCR du panel viral 2 et 104 (45,6 %) du panel viral 3 étaient positives. Sur 152 patients dont le résultat du panel viral 2 ou 3 était positif, 67 (44,1%) étaient sortis avant réception des résultats de la PCR. Sur 142 patients dont les données de prescription d'antibiothérapie étaient disponibles, 97 patients n'ont pas reçu d'antibiothérapie (68,3%), l'antibiothérapie de 4 patients était arrêtée (2,8%), 5 antibiothérapies étaient poursuivies (3,5%), et 35 patients se voyaient prescrire une antibiothérapie (24,6%). Chez les patients de 5 ans et moins hospitalisés pour infection respiratoire aiguë en service de pédiatrie ou lors d'un passage aux urgences, les panels Multiplex viraux (Adenovirus, Enterovirus, Parainfluenzae 1-2-3-4, Metapneumovirus, Bocavirus, Rhinovirus, Coronavirus NL63, 229E et OC43), au coût de 135€, malgré des taux de positivité importants, n'ont qu'un impact limité en terme de prise en charge antibiotique (28,1% de poursuite/initiation d'antibiothérapie malgré une documentation virale établie). Dans 44,1% des cas, leurs résultats n'influencent pas la décision d'hospitalisation ou de poursuite d'hospitalisation. Aucun lien d'intérêt
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