薰衣草叶绿体RNA编辑位点的预测与分析

RNA编辑是转录后水平的一种调控方式,在植物生长发育、形态建成以及逆境响应等过程具有重要作用.为明确薰衣草(Lavandula angustifolia)叶绿体RNA编辑的组成及其特点,本研究通过生物信息学和PCR,对薰衣草植物叶绿体的RNA编辑位点进行了预测和初步验证.结果发现,薰衣草叶绿体基因组中共预测到44个编辑位点,分布于19个基因上,且所有位点均为C到U的转变.利用PCR确认了 ndhB-737是ndhB的基因编辑位点之一.比较薰衣草与罗勒(Ocimum basilicum)、薄荷(Mentha haplocalyx Briq.)、紫苏(Perilla frutescens(L.)Britt.)、迷迭香(Rosmarinus officinalis)、益母草(Leonurus japonicus Houtt)这五种唇形科植物叶绿体RNA编辑位点,发现它们之间存在编辑位点的差异,其中atpF-31、rps2-83、rpoB-113、rpoB-189、rpoB-809、rps14-27、rp120-103、ccsA-187和ndhG-105这9个RNA编辑位点是这六种唇形科植物叶绿体所共有.本研究为薰衣草叶绿体RNA编辑的生物学功能研究奠定基础,为从RNA编辑角度阐明唇形科植物的起源进化关系提供一定依据.