薄壳山核桃Aux/IAA基因家族鉴定及其在嫁接愈合中的表达分析
Molecular Plant Breeding（2022）
摘要
Aux/IAA(Auxin/Indole-3-Acetic Acid)家族是生长素信号的早期响应基因家族之一,广泛参与调控植物的生长发育过程.薄壳山核桃(Carya illinoinensis)作为一种重要经济树种,对其Aux/IAA家族基因的鉴定具有重要意义.本研究利用生物信息学方法,在薄壳山核桃全基因组中鉴定出37个Aux/IAA家族基因,亚细胞定位发现其全部成员位于细胞核.根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,将37个薄壳山核桃Aux/IAA基因分为A、B两组.多重序列比对分析发现薄壳山核桃Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,分别为Ⅰ-Ⅳ.顺式作用元件分析发现所有薄壳山核桃Aux/IAA基因启动子区域都具有响应激素的作用元件.根据薄壳山核桃Aux/IAAs在嫁接愈合中的表达模式,挖掘出4个高表达基因,它们可能在嫁接愈合过程中起重要作用.本研究将有助于阐明薄壳山核桃Aux/IAAs在嫁接愈合过程中的功能并筛选候选基因.
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