灌溉水源中沙门氏菌的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法的建立
Fujian Journal of Agricultural Sciences(2023)
Abstract
[目的]建立基于SYBR Green I嵌合染料法的灌溉水源中沙门氏菌实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)检测方法.[方法]以沙门氏菌侵袭蛋白A(invA)基因为靶基因,设计 1对特异性qPCR检测引物,在对qPCR反应体系和反应条件进行优化后,通过特异性实验和灵敏度实验对qPCR方法进行验证,并制作灌溉水源中沙门氏菌qPCR定量标准曲线,最后与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染来验证该方法的准确性.[结果]经过优化的qPCR检测方法灵敏度检测结果显示最低检测限量为 1×10-1 pg·μL-1,特异性检测结果显示具有良好的特异性,干扰菌株对本qPCR检测方法无影响,所制作的qPCR扩增标准曲线在 2×100~2×105 cfu·mL-1有较好的线性关系,相关系数为 0.9996,能对沙门氏菌进行准确的定量分析.该方法在与国标方法对比检测灌溉水源中沙门氏菌污染时具有同等准确性.[结论]本研究建立的基于SYBR Green I嵌合荧光法的实时荧光定量PCR检测方法,可以满足灌溉水源中沙门氏菌的定量检测要求.
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Quantitative RT-PCR,Irrigated water,Salmonella
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