池塘养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠含物、附着基和底泥中的菌群结构及其相关性

2014年10月，利用PCR-DGGE技术分析了标准化养殖池塘中仿刺参(Apostichopus japonicus)肠含物及附着基和底泥中细菌的菌群结构及其相关性。结果显示, 仿刺参肠含物、附着基、底泥中细菌多样性较高，分别平均获得30.00±1.00、 15.33±1.70、 21.67±2.62条带，肠含物中细菌种类数显著高于附着基和底泥。聚类分析和戴斯系数表明，不同池塘的仿刺参肠含物样本单独聚为一支，相似性达到0.785，附着基和底泥样品聚为一支，平均相似性达到0.532。不同样品DGGE图谱中20条优势条带的切割、克隆、测序，共获得了20条细菌序列，表明肠含物细菌种类以聚球藻属(Synechococcus sp.)、脱硫杆菌属(Desulfobacterium)、脱硫叠球菌属(Desulfosarcina sp.)、极地杆菌属(Polaribacter)、 Algibacter sp.为主，附着基中主要以Robiginitalea sp.和Silicibacter sp.为主，底泥样品中主要以假单胞菌属(Proteobacterium）、噬胞菌属(Cytophaga）、 Desulfosarcina sp.为主，肠含物中细菌特有种类的分离与鉴定为仿刺参养殖潜在益生菌的开发提供基础数据。