棉花 SNC2 基因的克隆及表达分析
openalex(2016)
摘要
以陆地棉 ( Gossypium hirsutum )TM-1 为材料,利用同源克隆技术从棉花中分离出 SNC2 基因,以 actin 基因为内参,采用半定量 RT-PCR 分析该基因在棉花组织中的表达,并采用实时荧光定量 RT-PCR 分析不同棉花品种经大丽轮枝菌侵染后, SNC2 基因在接菌后的不同时段、不同组织的表达水平。研究分析发现该基因 CDS 序列长度为 1308bp ,编码 435 个氨基酸,蛋白的等电点 (pI) 为 6.98 ,理论分子量为 46.93 kDa ,命名为 SNC2 , GenBank 登录号为 AOO35322.1 , SNC2 基因编码多肽链中包含信号肽和跨膜结构域,且亚细胞定位于质膜,编码受体类蛋白。组织表达分析显示 SNC2 基因在主根、侧根、茎、叶和花中均有表达,茎中的表达量较高,而在苞片组织中基本不表达。该基因在接菌后的感病品种军棉 1 号的根和耐病品种中棉 49 号的茎中的表达量呈现不断上升的趋势,而在两个棉花品种的其他组织中呈现出 “ 升 - 降 - 升 ” 的趋势,且在不同抗性的棉花品种中的表达存在差异,暗示 SNC2 基因可能在不同抗性品种抵御生物胁迫过程中扮演重要角色, 研究结果为进一步研究 SNC2 基因的功能及应用提供依据。
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