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青稞苗期根腐病对根际土壤细菌群落结构的影响

Grassland and Turf(2023)

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摘要
[目的]明确青稞根腐病对根际土壤微生物细菌群落结构的影响.[方法]采集苗期健康青稞及根腐病发病率分别为5%、10%、15%、20%等不同发病率青稞根际土壤样品,采用Illumina MiSeq高通量测序技术测定各样品16S rDNA序列,并进行多样性分析.[结果]苗期青稞根际土壤细菌优势种属多,群落结构组成丰富,多样性及均匀性程度高.对不同分类水平下优势菌群分析发现,门水平下,根腐病的发生使变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的丰度升高,使酸杆菌门(Acido-bacteria)和放线菌门(Actinobacteria)丰度降低;目水平下,微球菌目(Micrococcales)、假单胞菌目(Pseudomonadales)和丙酸杆菌目(Propionibacteriales)的丰度降低,芽孢杆菌目(Bacillales)和鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)的丰度升高;属水平下,鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)、芽孢杆菌属(Bacil-lus)、假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter)的丰度升高,Pseudarthrobacter属丰度降低;种水平下,普城沙雷菌(Serratia plymuthica)丰度增加,简单芽孢杆菌(Bacillus simple)、醋酸钙不动杆菌(Acinetobacter calcoaceticus)及嗜根寡养单胞菌(Stenotrophomonas rhizophila)的丰度降低.聚类分析发现,根腐病的发生使青稞根际土壤细菌群落结构发生了变化,且总体呈现出发病率越高,与健康样品的距离越远,差异越大的规律.通过COG数据库注释得到青稞根际土壤细菌多个功能基因.[结论]青稞苗期根腐病的发生使根际土壤细菌群落结构发生了变化,这一研究为青稞根腐病的防控及预测预警技术的建立提供了理论依据.
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关键词
naked barley,root rot,high-throughput sequencing,soil bacteria,community structure
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