基于网络药理学和分子对接探讨三七治疗视网膜静脉阻塞的分子机制

Shi Suisui, Zhou Jian, Luo Yueyi, Gao Jun,Qi Baoyu,Chao Guojun

Chinese Pharmaceutical Affairs(2023)

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Abstract
目的:探讨三七治疗视网膜静脉阻塞(RVO)的分子作用机制.方法:采用TCMSP数据库及文献补充获得三七的有效成分,并在Swiss Target Prediction收集其作用靶点;使用GeneCards等5个数据库检索RVO疾病靶点,并将三七成分靶点与RVO疾病靶点进行映射;利用STRING、Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图,筛选出核心靶基因,对其进行GO和KEGG富集分析.最后,利用Sybyl-x2.0软件进行分子对接验证.结果:筛选出三七有效成分10种,涉及354种蛋白.RVO的疾病靶点有181个,其中9个是三七治疗RVO的潜在靶点"药物-活性成分-疾病-靶蛋白"相互作用网络中,核心作用靶点包括VEGFA、EGFR等;通过GO及KEGG富集分析,筛选出参与RVO主要生物学过程28种,相关信号通路18条.三七治疗RVO潜在的分子机制与纤溶等生物学过程密切相关,关键信号通路包括HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等.分子对接结果提示,三七主要活性成分DFV、Panaxydol等与VEGFA、EGFR等关键靶点有着较好的结合活性.结论:三七的多成分通过纤溶等多种生物学过程及HIF-1等多条生物学信号通路,多靶点、多通路、多效应作用于视网膜,进一步发挥治疗作用,而VEGFA、EGFR等可能是潜在作用靶点.
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Key words
Panax notoginseng,retinal vein occlusion,network pharmacology,molecular docking,molecular mechanism
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