建昌马Prdm9基因锌指序列的研究

ZHOU Fanli, YANG Le, HUANG Weiping,JIN Suyu,RAO Kaiqing, HUANG Lin,ZHENG Yucai

Chinese Journal of Animal Science(2023)

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摘要
本研究旨在分析建昌马Prdm9基因锌指域的遗传多样性和结构特征.实验选用建昌马(n=40),通过PCR扩增Prdm9基因锌指域并进行克隆测序.结果显示,建昌马Prdm9 锌指域中存在 15 种C2H2 型锌指,其中 8 个在马属动物上还没有报道;锌指间有 1~4 个氨基酸差异,并发生在 4 个固定位点上,其中 3 个为正向选择位点;在建昌马中检测到 16 种Prdm9 锌指域,大多数包含 9 个锌指,在群体中形成A~P共 14 种基因型,其中AJ基因型占明显优势,A和J(ZFD1、ZFD9)为优势等位基因;Prdm9 锌指域的基因杂合度、有效等位基因数、多态信息含量高,显示丰富的遗传多态性.本研究表明,建昌马Prdm9锌指和锌指域具有丰富的遗传多样性,其结构不同于马属动物中已有的报道.
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关键词
Jianchang horse,Prdm9 gene,Zinc finger,Genetic diversity,Species evolution
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