SMAD1基因在策勒黑羊卵巢不同生理期差异表达及生物信息学分析

本研究以SMAD1基因为研究对象,对策勒黑羊卵巢黄体期、卵泡期、妊娠期 30 d进行荧光定量分析,寻找SMAD1基因表达量的规律,探索策勒黑羊常年发情的分子机制.通过生物信息学方法对策勒黑羊SMAD1基因理化性质进行预测和分析.结果发现:SMAD1基因在妊娠期 30 d表达量最高,极显著高于黄体期和卵泡期,其表达量依次为妊娠期 30 d>卵泡期>黄体期;绵羊SMAD1基因位于 17 号染色体,核心启动子在 1912～1962 bp,没有CpG岛;SMAD1基因编码 464 个氨基酸,丝氨酸(Ser)所占比例最高为 10.6%;不稳定指数为 60.55,为不稳定亲水性蛋白;该蛋白定位于细胞核,无跨膜结构区域;主要的二级结构元件是由α-螺旋结构和无规则卷曲组成;进化树分析发现,绵羊和牛蛋白亲缘关系最近,同源性达 100%.本研究为策勒黑羊常年发情和高繁殖力的选育提供了理论基础.