大白猪胆汁酸代谢基因FXR的克隆及其在各肠道中的表达
Chinese Journal of Animal Science（2023）
Abstract
为了探究胆汁酸代谢途径关键基因FXR在大白猪中的结构和功能,本研究利用 3 头大白猪十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠组织,分别提取RNA,将RNA反转录成cDNA后做混池通过PCR扩增FXR基因的CDS区域,对测序结果进行比对确认,利用多种生物信息学软件对大白猪FXR基因的CDS区域进行了一系列分析.结果显示,FXR基因CDS全长 1461 bp,编码 486 个氨基酸,预测FXR蛋白二级和三级结构,该蛋白的二级结构有 23 个α螺旋、28 个β折叠、30 个T转角、20 个无规卷曲,为亲水性膜外蛋白;并且有多个磷酸化位点;荧光定量PCR结果显示,FXR基因在大白猪回肠中表达量极显著高于其他肠道组织.本实验成功克隆了大白猪FXR基因的CDS区域,为进一步探究FXR基因在猪胆汁酸代谢途径中的调控机制提供了研究基础,也为利用胆汁酸代谢调控挖掘提高猪生长性能的分子标记提供了一定参考.
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