杜氏盐藻对铜胁迫的转录组测序及功能注释分析

铜是植物体生长发育所必需的一种微量元素,铜缺乏或过量都会对植物的生长不利.杜氏盐藻(Dunaliella salina)是一种富含β-胡萝卜素、甘油等多种营养物质的真核绿藻.本研究分别对f/2 培养基(对照组)和 5.0 mg/L CuCl2(实验组)中培养 72 h的杜氏盐藻进行转录组测序,探讨铜胁迫对盐藻生长发育及不同信号通路的影响.结果获得41418个unigenes,其中注释到NR、COG、KEGG、Swiss-Prot和InterPro数据库的unigene分别有 22204、19524、15345、12136 和 18016 个.铜胁迫下共筛查到 3799 个差异表达基因,其中 2350 个基因上调,1449 个基因下调.对这些差异基因的GO和KEGG富集分析发现,铜胁迫可诱导光合作用、碳固定、铜转运蛋白及热休克蛋白等相关基因的表达,促进杜氏盐藻的生长,增强其对铜的耐受性.杜氏盐藻中发现了多个SNP和SSR结构位点.本研究结果为深入揭示杜氏盐藻铜胁迫下基因差异表达及分子机理提供了平台,也为其后续分子遗传学及表型性状等研究提供一定的理论依据.