基于DNA甲基化的中医概念与证候量化方法及其在抑郁症和癌症筛查中的应用
Chinese Journal of Pharmacology and Toxicology(2023)
Abstract
目的 探索基于DNA甲基化的中医概念量化表征方法.方法 采集集成抑郁症、轻度认知功能障碍、阿尔兹海默症、创伤后应激、焦虑障碍、产后抑郁症、骨质疏松、类风湿性关节炎、动脉硬化、脑卒中、乳腺癌、肠癌、肺癌等多种疾病的多组学数据,以及以中医术语注释的中药功效、药性、化学成分、靶标数据.提出了SEMO算法,计算干扰物与疾病表型的统计相关性.干扰物=药物/天然产物成分/营养素/中药/中医证候/中医治法.结果 DAMOPA计算框架实现了基于DNA甲基化的中医证候、治法、方剂排序功能.在新冠重症预测、抑郁症、认知功能筛查、癌症预警等应用中,相比GO等本体论,中医证候标志物表型相关性更强,有因果涌现现象.开发的DNA甲基化捕获测序试剂盒,实现了基于唾液甲基化检测的中药复方计算("甲基化开方")、用证候甲基化标志物分析中药作用机制.结论 通过DNA甲基化数据可以量化表征中医概念,中医证候与现代医学通路分析可以在同一个计算框架内实现.
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