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纳米孔测序在肿瘤并发感染中的应用

LIU Xi, LIU Xin, CAI Jingjing,DU Yaxi,LI Hongsheng,ZHOU Yongchun

Journal of Kunming Medical University(2023)

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摘要
目的 评估纳米孔测序在肿瘤患者并发感染性疾病中的临床应用价值,为肿瘤患者感染性疾病的快速、灵敏诊断提供新的检测方法.方法 收集 2022 年 7 月至 8 月云南省肿瘤医院 36 例疑似感染的肿瘤患者样本 46 份,利用纳米孔测序鉴定样本中的病原微生物.结果 纳米孔测序细菌检出率 72.22%,真菌检出率31.48%,病毒检出率 42.59%.细菌和真菌检出率均较微生物培养法(23.91%和 10.87%)明显升高(χ2 = 23.19,P<0.0001;χ2 = 13.14,P= 0.0003).纳米孔测序结果与微生物培养结果比较,检出的细菌和真菌种属明显增多.结论 纳米孔测序鉴定病原微生物具有检出率高,检测病原菌种属广,诊断快速的优势,在肿瘤并发感染性疾病的诊断中具有潜在的临床应用价值.
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关键词
Nanopore sequencing,Tumor,Infection,Pathogenic microorganisms,Microbial culture
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