2个烟草青枯病菌菌株的致病力差异与基因组比较分析

[目的]探索比较 2 个不同青枯病菌菌株之间致病力差异和基因组差异,分析影响菌株致病力差异的关键基因,为烟草青枯病的防治提供理论参考.[方法]从烟草青枯病发病烟株上分离获得不同的青枯病菌菌株并进行鉴定,通过侵染试验比较 2 个菌株之间的致病力差异,并对 2 个菌株的基因组进行测序,比较二者之间基因组序列差异,分析影响菌株致病力差异的基因.[结果]从江西省抚州市广昌县和南丰县分离到2 株青枯病菌菌株RsTP2 和RsTY2,egl测序表明菌株RsTP2 和RsTY2 均属于亚洲分支演化型Ⅰ中的序列变种13,其中菌株RsTP2 对云烟 87 致病力较强,而菌株RsTY2 致病力较弱.通过对 2 个菌株进行基因组测序,获得二者的基因组框架图,其基因组大小分别为 5.43 MB和 5.23 MB.将获得的基因和蛋白序列与相关数据库进行比对,获得基因的功能及物种注释信息.通过分析发现,菌株RsTY2 有 52 个蛋白和菌株RsTP2 的 44 个蛋白比对后序列存在差异,其相似度在 50.00%～99.88%,其中存在较大差异的编码蛋白主要是凝集素类蛋白,其次是细胞溶素分泌激活蛋白和穿孔素家族蛋白.[结论]通过比较不同致病力青枯病菌株RsTP2 和RsTY2 的基因组序列差异,发现二者基因组中编码凝集素类蛋白、细胞溶素分泌激活蛋白和穿孔素家族蛋白等蛋白序列差异较大,这类编码蛋白主要参与细菌的黏附、膜溶解、穿透等功能,与细菌侵入宿主细胞的能力关系密切.这几类编码蛋白的差异推测是导致菌株RsTP2 和RsTY2 致病力差异的重要因素之一.