不同生境黑老虎根际和内生真菌多样性分析
Guihaia(2023)
Abstract
为探究不同生长条件下黑老虎根际和根部内生真菌群落组成和多样性及其与土壤环境因子的相关性,该文应用Illumina高通量测序方法对贵州 3 个不同生境下黑老虎根际和根部内生真菌进行了研究.结果表明:(1)3 种生境下,根际土壤真菌OTU数量(3 867)远多于根部内生真菌(801),其中根际土壤真菌共有的OTU为 72 个,共注释到 5 个门、49 个属,大多为子囊菌门;属水平上被孢霉属、外瓶柄霉属、柱孢属占比较高;根部内生真菌共有的OTU为14 个,共注释到2 个门、11 个属,子囊菌门(13 个,占比92.9%)占绝对优势,属水平上被孢霉属、外瓶柄霉属、柱孢属和丛赤壳属占比最高;所有样本中,共有的OTU仅为 6 个,注释到 2 个门、5 个属,子囊菌门(5 个,占比 83.3%)为优势门;在属水平上,占比最高的为外瓶柄霉属(2 个,33.3%),其余分别为被孢霉属、柱孢属和丛赤壳属.Alpha多样性分析表明,根际土壤的真菌群落多样性和丰富度均显著高于根部内生真菌,而野生生境的真菌多样性高于栽培生境.(2)在门水平上,3 个生境下主要内生真菌类群均为子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota),占总菌群的 88.28%;在属水平上,不同生境条件下,根际和根部内生真菌群落结构差异明显;栽培生境下,根部内生真菌菌群具有一定的偏好性,而野生生境下,根部内生真菌菌群均匀度更高;FUNGuild真菌群落功能预测显示,栽培生境下的病理-腐生营养型(pathotroph-saprotroph)在根部内生真菌中占比较高,而野生生境下的腐生营养型(saprotroph)及共生营养型(symbiotroph)占比较高.(3)土壤环境因子对根部内生真菌和根际真菌的影响方式不同,其中土壤总钾(TK)和土壤总磷(TP)与黑老虎根部内生真菌香农指数和辛普森指数显著正相关,而土壤有机质(SOM)、总氮(TN)和速效氮(AN)与黑老虎根际土壤真菌Ace指数和Chao1 指数显著正相关.综上表明,SOM、TN、AN是影响黑老虎根际土壤真菌群落的主要土壤环境因子.
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Key words
Kadsura coccinea,ITS,Illumina high-throughput sequencing,fungal community,soil environmental factors,diversity
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