Épidémiologie de la diphtérie sur un territoire d'outre-mer

Le nombre croissant d'isolement de Corynebacterium diphtheriae relevé sur le territoire étudié, la potentielle gravité de cette infection et la répercussion en terme d'actions de santé publique à mettre en place, nous ont incités à nous intéresser plus particulièrement à cette espèce bactérienne et à son épidémiologie locale. Toutes les souches de C. diphtheriae isolées, identifiées par MALDI-TOF et conservées durant la période de mai 2015 à mai 2019, sur le territoire concerné, ont été inclues dans notre étude : 58 épisodes ont été rapportées. Pour chaque cas, une étude clinique rétrospective a été réalisée par consultation des dossiers patients, les antibiogrammes ont été retestés, le gène tox recherché, le biovar déterminé, les souches séquencées et un arbre phylogénétique a été réalisé en se basant sur le core génome de notre cohorte. Dans notre cohorte, le sexe ratio était de 1,07, le patient le plus jeune avait 9 jours et le plus âgé 78 ans. Nous notons une concentration des cas en particulier autour de la ville principale (24 %, 14/58) et d'une commune peu peuplée (26 %, 15/58) Cette répartition géographique inégale est en partie expliquée par la répartition des MALDI-TOF sur le territoire et par des pratiques de prélèvement différentes d'un centre à un autre. Les prélèvements ont été réalisés pour 88 % (51/58) au niveau cutané. La souche a été retrouvée en association avec S. aureus et/ou S. pyogenes dans 74 % (43/58) des cas. Deux cas d'endocardites chez des patientes jeunes ayant des antécédents de rhumatisme articulaire aigu ont été inclus et concernent des souches tox-. Les souches présentes sur le territoire sont globalement sensibles à la majorité des antibiotiques couramment utilisés, en particulier aucune souche n'est résistante à l'amoxicilline ou à l'erythromycine, antibiotiques de première intention. On note cependant 29 % (17/58) de souches résistantes à la tétracycline, chez toutes ces souches sauf une, la résistance est corrélée à la présence du gène tetO. Nos souches appartiennent à 13 sublineages différents, dont deux peu retrouvés ailleurs dans le monde, sont particulièrement représentés et réunissent 64 % (37/58) de nos souches. Les souches ne possèdent pas le gène de la toxine diphtérique pour 90 % (52/58) des cas. Les cas tox+ sont répartis en deux épisodes, de 1 cas et 5 cas, tous importés d'un pays voisin. Tous les isolats de l'étude possédant le gène spuA sont de phénotype Gravis, et seulement 4 isolats de phénotype Gravis ne possèdent pas le gène spuA. L'évolution des référentiels utilisés pour la réalisation des antibiogrammes tend à rendre les souches plus souvent résistantes sans réalité biologique lorsque l'on applique la même technique à toutes les souches. Des portages asymptomatiques et découvertes fortuites font penser qu'il y a un nombre important de souches tox- sur le territoire, qui circulent largement silencieusement. Quelques cas d'introduction de souches tox+ via un pays voisin indiquent qu'une attention particulière doit être portée en ce qui concerne la couverture vaccinale de la population. Aucun lien d'intérêt