基于miR-145-3p等miRNA构建膀胱癌6miRNA预后模型及验证

目的 基于癌症基因图谱计划(TCGA)数据库筛选microRNAs(miRNAs)构建膀胱癌预后风险模型,为膀胱癌诊断和预后的可靠miRNA标志物的开发提供理论基础.方法 从TCGA数据库获得膀胱癌原始数据及相应的临床资料,使用R语言4.0.4版本及其附属包进行分析,采用单因素及多因素Cox回归分析所构建的膀胱癌预后风险模型.利用受试者工作特征曲线(ROC)和曲线下面积(AUC)评估模型的灵敏度和特异度.对预测的靶基因进行功能分析并筛选关键差异靶基因(Hubgene).利用RT-qPCR验证miRNA在膀胱癌及癌旁组织中的表达.结果 构建的膀胱癌预后风险模型,其训练集(train)组、测试集(test)的AUC值分别为0.781和0.644.基于蛋白质互作分析获得10个关键差异靶基因(Hub gene),其中NRXN1与PDGFRA与生存预后相关(P值均＜0.05).RT-qPCR结果显示,6个miRNA在膀胱癌及癌旁组织中表达的差异均有统计学意义(P值均＜0.05).结论 本研究构建的6 miRNA膀胱癌预后风险模型预测性能良好,其潜在靶基因NRXN1有望成为评价生存预后情况的新标志物.