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基于网络药理学和分子对接方法探讨侯炜教授辨治脑胶质瘤的用药机制

Western Journal of Traditional Chinese Medicine(2023)

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Abstract
目的:利用中医传承辅助平台分析侯炜教授治疗脑胶质瘤的用药规律,并通过网络药理学方法探讨核心药组多成分-多靶点-多通路治疗脑胶质瘤的作用机制.方法:严格按照疗效判定标准筛选处方,利用关联规则分析显效及有效处方,在TCMSP数据库筛选核心药组的有效成分及靶点,并与OMIM、TTD、GeneCard、DisGeNET数据库筛选所得脑胶质瘤基因取交集,得到候选靶点.借助Cytoscape 3.8.0构建"化合物-靶点-疾病"网络,在STRING平台构建PPI网络,设置拓扑参数筛选核心靶点.利用Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,通过AutoDock Vina软件和Python脚本将核心化合物与核心靶点进行分子对接.结果:共纳入方剂249首,挖掘得到核心药物组合,并筛选活性成分227个,候选靶点30个,KEGG通路165条和GO功能739个.KEGG通路主要为丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase,MAPK)信号通路、低氧诱导因子1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、癌症相关信号通路.分子对接显示靶点与成分结合活性良好.结论:核心药组可能通过肿瘤蛋白P53、肿瘤坏死因子、MAPK1、MAPK8等靶标作用于MAPK信号通路、HIF-1信号通路及癌症相关信号通路等发挥作用.
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Key words
brain glioma,TCMSP,network pharmacology,molecular docking
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