网络药理学联合生物信息学及分子对接探索黄芪甲苷抗肝癌的作用机制

目的 利用网络药理学结合TCGA和GEO数据集以及分子对接系统性探索黄芪甲苷抗肝癌的分子机制.方法 通过CTD、OMIM及PharmMapper数据库预测黄芪甲苷靶点.计算TCGA和GEO数据集差异基因作为肝癌预测靶点并检索CTD和GeneCards数据库作为补充.用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点."clusterProfiler"R包用来对靶点富集分析.运用AutoDuck和PyMOL软件进行分子对接.结果 共预测到 201 个黄芪甲苷抗肝癌靶点,主要与老化、氧化应激及脂质代谢有关,且京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集通路与肝癌密切相关.201 个靶点中有9 个关键靶点,分子对接发现白细胞介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)、白蛋白(ALB)与黄芪甲苷有良好结合力.结论 黄芪甲苷通过多靶点和多通路实现抗肝癌作用.