一株支气管炎鲍特杆菌国家标准菌种的再鉴定
Journal of Microbiology（2023）
摘要
通过生化试验、质谱鉴定、16SrRNA基因序列分析、全基因组序列测定及生物信息学分析等方法对国家标准菌种CMCC(B)40001进行再鉴定.对菌株的毒力、耐药和MLST进行分析,并对鲍特杆菌(Bordetella spp.)的群体进化进行分析.结合不同方法,CMCC(B)40001再鉴定为支气管炎鲍特杆菌(Bordetella bronchi-septica),且其作为标准菌种能够发挥国家标准描述的质控作用.同时获取该菌株的新ST型,在进化关系上,其与百日咳鲍特杆菌(Bordetella pertussis)和副百日咳鲍特杆菌(Bordetella parapertussis)遗传距离近.本研究再鉴定了国家标准菌种CMCC(B)40001为支气管炎鲍特杆菌,并分析了其遗传特征,为国家标准菌种的应用提供资源描述支持.
更多关键词
bacteria identification,mass spectrometry identification,genome sequencing,group evolutionary relation-ship analysis,quality control
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