基于AutoDock Vina筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶有效组分的研究

目的 基于分子对接方法筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶的有效组分.方法 使用AutoDock Vina软件对徐长卿[Cynanchum paniculatum(Bunge)Kitag]中化合物与尖吻蝮蛇(Deinagkistrodon acutus)蛇毒金属蛋白酶进行分子对接,采用ADMET对较高结合能组分进行毒性分析,筛选有效抑制组分.结果 与阳性对照穿心莲内酯的对接结合能比较,从徐长卿中筛选出17 种具有较高结合能的化合物.通过SwissADME预测毒性,确定10 种潜在的无毒性化合物,分别为Cinatra-toside B、Paniculatumoside D、Glacoside A、Cynapanoside A、Paeonolide、Paniculatumoside A、Cynatratoside A、Paniculatumoside B、GreenOil、1,6-Dimethylnaphthalene.结论 基于AutoDock Vina虚拟筛选,从徐长卿中筛选出10 种具有潜在抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶活性的化合物.