基于线粒体DNA D-Loop区分析我国沿海厚壳贻贝群体遗传结构
Journal of Zhejiang Ocean University(Natural Science)(2020)
Abstract
基于野生厚壳贻贝的线粒体DNA D-Loop区,对我国沿海6个群体(青岛、舟山、玉环、台山、平潭、厦门)的129个厚壳贻贝个体进行遗传多样性及遗传结构分析,获得1 113 bp的同源序列,共检测到31个变异位点,得到35个单倍型.A+T含量(64.2%)显著高于G+T含量(35.8%),具有明显的碱基组成偏倚性.结果显示出较高的遗传多样性水平,单倍型多样性(h)为0.853~0.912,核苷酸多样性为(π)为0.005 55~0.007 36.群体之间的FST值(-0.021 79~0.076 30)水平较低,差异几乎不显著;通过Nm值(3.026 54~32.429 74)发现,基因均质化现象明显,基因流导致种群间分化程度甚小.系统进化树显示舟山群体与其他种群有分化现象,但另外5个地区种群的分化程度不高,AMOVA结果显示种群分化都来自于种内,种群间几乎没有遗传分化.单倍型网络图显示6个群体的单倍型没有明显的单支分化.
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