基于SSR分子标记的裸花紫珠种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

目的 研究裸花紫珠Callicarpa nudiflora种质资源遗传多样性,为其种质资源鉴定及优异种质筛选提供依据.方法 采用SSR分子标记技术,探究103份裸花紫珠种质遗传多样性,基于遗传距离进行UPGMA聚类分析,以SSR扩增条带为基础建立供试材料扩增条带DNA指纹图谱.结果 14对引物共扩增出92个等位基因(number of alleles,Na),有效等位基因(effective number of alleles,Ne)占比 39.37％.平均多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.468 2,6对引物具有高度多态性(PIC＞0.5),6对具有中度多态性(0.25＜PIC＜0.5).平均Nei多样性指数(Nei's gene diversity index,H)和 Shannon 指数(Shannon's information index,I)分别为 1.039 0、0.505 1,表现出较高的遗传多样性水平.聚类分析将材料分为2大类:类群Ⅰ包括2份种质;类群Ⅱ包含101份种质,并分为2个亚类.主坐标分析将材料分为3个类群,与聚类结果基本一致.构建的指纹图谱通过引物组合能较好地将种质进行区分.结论 103份裸花紫珠种质具有丰富的遗传多样性,并成功利用14对SSR引物构建裸花紫珠种质DNA指纹图谱,可为裸花紫珠种质鉴定、亲缘关系以及分子辅助育种提供科学依据.