栀子AP2基因家族成员鉴定及其在盐胁迫下的表达模式
Journal of Fujian Agriculture and Forestry University(Natural Science Edition)(2023)
Abstract
栀子耐干旱、耐瘠薄,适应性强.AP2/ERF(APETALA2/乙烯反应元件结合因子)基因家族成员在调控植物胁迫中起着关键作用,分析AP2 转录因子家族成员对探究栀子耐盐机制具有重要意义.基于全基因组数据,鉴定栀子AP2 基因家族成员并进行理化性质和系统发育分析,明确栀子在不同浓度盐胁迫下的表达模式.结果表明:在栀子中鉴定出 113 个AP2 基因家族成员,所编码蛋白平均分子质量为 26 323.08 u,等电点为 4.51~10.2,脂肪指数为 30.47~71.02,蛋白不稳定且亲水;蛋白二级结构以无规则卷曲(54.82%)为主,大部分定位在细胞核中,AP2 和DREB亚家族成员定位在细胞质中的概率较大;AP2 基因家族成员分属AP2(11 个)、DREB(38 个)、RAV(1 个)和ERF(63 个)亚家族;AP2 基因家族成员进化的主要动力是纯化选择;大部分AP2 基因家族成员的基因复制类型属于分散复制或片段重复;AP2 基因家族成员启动区域中含有较多G-box、ABRE和CAT-box顺式作用元件;ERF亚家族成员Ⅹ类基因GjERF19、GjERF21 和GjERF46 积极响应盐胁迫,这 3 个基因将为栀子盐胁迫研究提供初步思路.盐胁迫试验结果表明栀子生长的土壤盐浓度应小于 100 mmol·L-1.
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