基于网络药理学探讨桃红四物汤治疗肺纤维化的作用机制
Clinical Journal of Chinese Medicine(2021)
摘要
目的:应用网络药理学技术探讨桃红四物汤治疗肺纤维化的作用机制,揭示其发挥作用的靶点及通路.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得桃红四物汤六味中药的活性成分及其相关靶点,利用Cytoscape软件构建中药-活性成分-靶点网络图.在Uniprot数据库中进行名称转化后得到规范的基因靶点名称.在GeneCards数据库中筛选肺纤维化疾病相关靶点,利用Excel表格获取疾病与药物的共同靶点后在利用String数据库及Cytoscape软件制作蛋白质-蛋白质相互作用网络图.将共同靶点信息在DAVID数据库分析后得到基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用微生信在线作图工具得到GO功能气泡图及KEGG通路气泡图.结果:共收集到桃红四物汤活性成分62种,基因靶点217个,肺纤维化疾病靶点343个,桃红四物汤与肺纤维化疾病共同靶点45个.共同靶点中以白细胞介素-6、肿瘤坏死因子、基质金属蛋白酶9、白细胞介素-1β等作用明显.共同靶点主要参与肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B信号通路、缺氧诱导因子-1信号通路等信号通路发挥作用.结论:桃红四物汤可能是通过肿瘤坏死因子信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等信号通路发挥其拮抗肺纤维化的作用.
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