烟草TCP基因家族的鉴定及表达分析
Biotechnology Bulletin（2023）
Abstract
TCP基因是植物特有的转录因子,对植物的生长发育起到重要的作用.鉴定烟草TCP基因家族,为烟草TCP基因功能研究及遗传改良提供理论依据.基于烟草全基因组数据,通过BLAST对烟草TCP基因家族进行鉴定,利用生物信息学的方法分析了该家族成员的理化性质、基因结构、蛋白质结构域、染色体分布、系统进化及启动子分析,并利用RT-qPCR验证了TCP基因家族在烤烟不同品种各个组织的表达情况.烟草中共鉴定了 20 个TCP基因,将其分为两大类Class I与Class Ⅱ;已知的TCP基因位于不同的染色体上且分布不均匀,所有TCP基因均具有保守的结构域;TCP基因家族启动子区域显著富集生长发育和激素响应的顺式元件,部分TCP基因还具有低温胁迫的作用元件;20 个NtTCPs基因在K326 和Ti706 不同组织和不同时期叶片内存在不同程度的表达,NtTCPs基因在烟草K326 和Ti706 中的表达具有组织特异性.其中Class I亚族基因在 6 个组织和苗期叶片内表达水平较高,而Class Ⅱ亚族基因在幼苗叶片、上部叶和中部叶表达水平较高.研究结果揭示了烟草TCP基因家族成员在烟草生长发育过程中起到重要作用,为探究烟草TCP基因家族的生物学功能提供了基础.
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