新冠病毒感染者病毒RNA脱落时间的影响因素研究

目的:了解新冠病毒感染者病毒RNA脱落时间与病毒单核苷酸突变和感染者人口、基础疾病等因素的关系，为新冠病毒感染动力学的研究提供更多线索。方法:收集江苏省2021年7月至9月暴发的一起新冠肺炎聚集性疫情感染者流行病学、临床表现、基础疾病等资料，采集病例鼻咽拭子样本，采用二代测序技术对样本进行病毒全基因组测序。利用在线分析平台判断病毒型别、分析突变位点，利用Cox比例风险模型分析新冠病毒RNA脱落时间与各研究因素的关系。结果:本起新冠疫情最终获得病毒全基因组序列的人员350例，其中女性占60.3%，年龄中位数49岁[四分位数间距( IQR，37~65岁)]，中位病毒RNA脱落时间33天( IQR，26~44天)。全基因组测序分析显示，同武汉参考株序列相比，感染者序列存在34~41个核苷酸突变位点，属于VOC/Delta变异株(B.1.617.2进化分支)，C346T、C1060T、T2803C、T7513C、A29681C为本起疫情350例病例新冠病毒基因组序列主要单核苷酸变异位点(SNP)。单因素Cox回归分析显示，年龄、基础疾病、临床分型、疫苗接种情况、SNP T2803C和T7513C对新冠病毒RNA的脱落时间存在影响；调整后的多因素Cox回归结果显示，年龄[ HR＝0.73，95% CI(0.55，0.95)]及T7513C[ HR＝0.37，95% CI(0.18，0.77)]仍然是新冠病毒RNA脱落时间延长的危险因素。 结论:本研究从病例个体因素和病毒单核苷酸变异两个角度分析了对病毒RNA脱落时间的影响，发现年长、患有高血压、较重临床症状、未接种或未全程接种疫苗，感染病毒存在T7513C突变者，存在新冠病毒RNA脱落时间较长的风险，应给予重点关注和康复后随访。