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杭州市2020—2021年男男性行为人群HIV-1感染者分子网络及治疗前耐药特征

International Journal of Epidemiology and Infectious Disease(2023)

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Abstract
目的:了解杭州市男男性行为人群(men who have sex with men, MSM)HIV-1感染者的分子网络及治疗前耐药特征。方法:收集杭州市2020—2021年新确证HIV-1感染且未经抗病毒治疗的MSM病例血样,扩增HIV-1 pol区基因并测序。使用MEGA6.0软件构建系统进化树判断亚型,通过Cytoscape3.7.0软件绘制分子传播网络图。使用美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线分析耐药情况。 结果:共获得1 158条 pol基因序列和9种HIV-1亚型,以CRF07_BC(49.9%,573/1 158)和CRF01_AE (36.7%,425/1 158)为主。初始CD4 +T淋巴细胞个数在不同亚型间的差异有统计学意义( χ 2=37.02, P<0.001)。以1.0%基因距离阈值绘制HIV-1分子传播网络,形成104个传播簇(簇内病例数2~72例),入网率34.7%(402/1 158);发现一个包含72例患者的CRF07_BC活跃传播簇。治疗前耐药株流行率为7.5%(87/1 158);对蛋白酶抑制剂的耐药突变发生率最高(3.5%,41/1 158),突变位点以Q58E为主(61.0%,25/41),发现3例患者对非核苷类逆转录酶抑制剂和核苷类逆转录酶抑制剂同时耐药。 结论:杭州市MSM HIV-1感染者的感染亚型多样化,存在CRF07_BC活跃分子传播大簇;治疗前耐药处于中度流行水平,存在抗病毒治疗一线药物多重耐药。
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Key words
HIV-1,Subtype,Molecular network,drug resistance,Genotype
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