2020年西藏自治区0~5岁健康儿童携带埃可病毒11型的基因特征分析

目的:本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型（echovirus11，E11）的基因特征进行研究，掌握肠道病毒的流行情况，填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法:收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康儿童的粪便标本，通过病毒分离和肠道病毒分子定型方法，对阳性病毒分离物进行肠道病毒血清型鉴定，并对鉴定结果为E11的病毒分离物进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定和分析。使用MEGA软件构建基因进化树（最大似然法），与中国其他省份E11和全球E11进行遗传进化分析。结果:574份粪便标本中分离到89株肠道病毒分离株，其中E11有44株，是主要的血清型，VP1区核苷酸序列之间的相似性为96.4%~100%，在系统发育树上呈现为多个传播链，但均属于D5基因亚型，且与我国2017年后其它省份E11流行株聚为一簇。结论:本研究获得了我国西藏自治区流行的E11的基因特征的基本信息，并了解了全球E11的基因型分布。