广东地区致雏鹅痛风鹅星状病毒的鉴定及遗传演化分析

Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine(2023)

引用 0|浏览12
暂无评分
摘要
为了解广东地区鹅星状病毒(GoAstV)的流行和变异情况,本研究于2019年~2021年从广东清远、广州、江门和汕尾4个地区采集83份疑似患痛风雏鹅的肝脏和肾脏病料样品.制备的组织病理切片结果显示,痛风雏鹅肝脏和肾脏组织出现大量的炎性细胞浸润和细胞坏死,经RT-PCR检测鉴定到其中72份样品为GoAstV阳性.从4个地区各选1份阳性样品对鉴定到的GoAstV进行全基因组的PCR扩增,结果显示获得4株长度均为7 033 bp的GoAstV全基因组序列.采用MegAlign分析的核苷酸同源性结果显示,4株GoAstV全基因组序列的同源性为98.4%~99.4%,与报道的GoAstV-2参考株全基因组序列的同源性为97.1%~99.7%,而与GoAstV-1全基因组序列的同源性仅为57.3%~57.7%.与其他禽星状病毒相比,GoAstV与火鸡星状病毒2型(TAstV-2)的同源性最高,其全基因组序列同源性约为65.0%~65.3%.Cap蛋白的氨基酸序列分子特征分析结果显示,4个鉴定株Cap蛋白的氨基酸序列均发生了Y36H 突变,其中GoAstV/Guangdong/NH2/2019和GoAstV/Guangdong/GZ-HOD/2021 Cap蛋白氨基酸序列还发生了E456D等突变.采用MEGA7.0软件构建GoAstV全基因组和Cap基因的遗传进化树,结果显示GoAstV可划分为GoAstV-1和GoAstV-2两个分支,本研究鉴定到的4株GoAstV均属于GoAstV-2分支.本研究首次初步揭示了广东地区鹅群GoAstV的流行特点和遗传变异情况,为GoAstV感染的防控和疫苗株的筛选提供参考.
更多
AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要