东北马鹿ELK1基因CDS序列克隆及其生物信息学分析

WU Shiyao, LUO Zhaocong, GAO Yang,HAN Qing, SUO Jingyuan, JIN Qingmei,ZHENG Dong,LIU Xuedong

Heilongjiang Animal Science and Veterinary Medicine（2023）

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摘要

为探究东北马鹿ELK1基因CDS序列信息,试验进行了 mRNA反转录、CDS序列扩增,测定ELK1基因CDS序列,克隆并构建蛋白表达载体,利用生物信息学方法对该基因编码的蛋白质结构及理化性质等进行了预测与分析.结果表明:东北马鹿ELK1基因转录产物CDS序列全长为1 323 bp(GenBank登录号为ON212657),编码440个氨基酸,分子量为46 200.42 u.核酸序列具有进化保守性,与牛ELK1基因同源性最高,为97.99％.ELK1多肽链具有亲水性,没有分泌信号肽结构,等电点为5.81,蛋白质为不稳定蛋白.ELK1蛋白的二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链、β-折叠组成,存在ETS DNA结合域,亚细胞定位于细胞核.

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