广西地区牛库布病毒RT-PCR检测及其遗传进化分析

为了了解广西地区奶牛、肉牛的牛库布病毒(bovine Kobuvirus,BKV)感染情况及分子特征,试验采用RT-PCR的方法对从广西地区采集的奶牛粪便177份、肉牛粪便27份(共204份粪便,其中腹泻牛粪便82份,健康牛粪便122份)进行BKV和其他肠道病毒的检测,分析BKV与其他肠道病毒的共感染情况,以及不同地点和不同季节BKV的感染情况,同时对广西地区BKV的3D基因与国内外30株库布病毒的3D基因进行核苷酸序列同源性分析和遗传进化分析.结果表明:广西地区BKV的感染率为2.94％(6/204),均从腹泻牛粪便中检出,其中奶牛和肉牛的感染率分别为2.26％(4/177)、7.41％(2/27),将6株毒株分别命名为BKV-GXGG01(贵港株)、BKV-GXHC01(河池株)、BKV-GXHC02(河池株)、BKV-GXNN01(南宁株)、BKV-GXNN02(南宁株)和 BKV-GXNN03(南宁株);BKV与牛病毒性腹泻病毒、牛肠道病毒和牛星状病毒存在混合感染,感染率为66.67％(4/6),而单一感染率为33.33％(2/6);6株广西地区BKV毒株的3D基因间的核苷酸序列同源性为93.5％～100％,与国内外Aichivirus B类型参考毒株间的核苷酸序列同源性为89.9％～95.1％,与其他库布病毒参考毒株的核苷酸同源性为35.9％～75.2％;6株广西地区毒株在遗传进化分析中均属于Aichivirus B类型,毒株BKV-GXNN01与日本株K-35、河南株B4、内蒙古株H6和H18、山东株C2、黑龙江株SC7-5、辽宁株H9同属一分支,其余5株毒株BKV-GXGG01、BKV-GXHC01、BKV-GXHC02、BKV-GXNN02、BKV-GXNN03与北京株B1213、泰国株CMB02、日本株U-1同属一分支.说明在广西地区奶牛、肉牛的腹泻病例中均存在BKV感染,推测BKV可能与牛腹泻有关.