三疣梭子蟹IAG基因结构及不同剪切体时空表达

LAN Wei-kang, LI Guang,GAO Bao-quan, LIU Ping,Lyu Jian-jian

Journal of Guangdong Ocean University(2023)

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摘要
[目的]分析三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)IAG(PtIAG)基因的结构及不同剪切体的时空表达模式,揭示其在性别分化中的功能及作用机制.[方法]基于NCBI数据库的甲壳动物IAG基因序列构建ML系统进化树.利用生物信息学软件对PtIAG基因的DNA结构及启动子区域进行分析.利用PCR技术对PtIAG基因进行可变剪切分析.利用qPCR技术对PtIAG基因进行时空表达分析.[结果]ML系统进化树显示,PtIAG基因与其他蟹类IAG基因的进化关系更近.PtIAG基因包含4个外显子和3个内含子,全长2615 bp.核心启动子位于起始密码子(ATG)上游2834 bp,启动子区域包括SOX-5、SOX-9、DSX等转录因子识别位点.PtIAG基因存在2种不同的转录本,其中PtIAG2为内含子保留型可变剪切转录本.qPCR结果显示,在幼体发育时期,PtIAG基因主要在溞状幼体Ⅰ期的雄蟹中表达;在成体组织中,PtIAG基因主要在促雄性腺中表达.[结论]PtIAG基因在三疣梭子蟹雄性分化及维持中具重要功能.
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