血满草叶绿体基因组结构与特征分析

为研究血满草叶绿体基因组结构与特征,以血满草新鲜叶片为材料,提取叶绿体 DNA,对叶绿体基因组进行测序、组装,并对其大小、结构、基因组成、简单重复序列(SSR)位点、密码子偏好性以及系统发育进行分析.结果表明,血满草叶绿体基因组长度为 158 610 bp,包括大单拷贝区(LSC,87 345 bp),小单拷贝区(SSC,18 937 bp)以及两个反向重复序列(IRa和IRb,26 164 bp),总G+C含量为 37.61％;血满草叶绿体基因组共编码到 131 个基因,包括 86 个蛋白编码基因,37 个转运 RNA基因,8 个核糖体 RNA 基因.序列鉴定共发现 6 种类型的 SSR,包括 4 种单核苷酸、2 种二核苷酸;17 个基因包含 1 个或 2 个内含子,其中 11 个位于蛋白质编码基因中,6 个位于 tRNA基因中;86 个蛋白编码基因包含 80 364 bp,编码 26 788 个密码子;系统发育分析显示,血满草与接骨木有较近的亲缘关系.