鸡成纤维细胞生长因子家族生物信息学特性及表达调控

[目的]探索鸡成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factor,FGF)家族的生物学特性及表达调控,为进一步研究FGF家族相关成员的生物学功能奠定基础.[方法]利用在线软件对鸡FGF家族19个成员的生物信息学特性进行系统分析;利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术对鸡FGF家族成员的组织时空表达特性及雌激素对FGF19和FGF23基因表达的影响进行分析;利用主成分分析对鸡FGF家族基因的遗传变异及其对不同鸡品种形成的贡献进行分析;采用混合线性模型对FGF19基因上的遗传变异与固始鸡不同阶段产蛋量进行关联分析.[结果]鸡FGF家族各成员均有1个相同的保守基序和FGF结构域.鸡FGF家族19个成员聚类在3个分支上.主成分分析显示,鸡FGF家族有助于蛋鸡和肉鸡品种分类.鸡FGF家族各成员在肝脏、肾脏、十二指肠、卵巢和腹脂器官中均有表达.FGF19基因在产蛋高峰期(30周龄)的卢氏鸡肝脏的表达水平显著高于产蛋前期(20周龄),而FGF23基因的表达水平无显著变化.雌激素可显著下调鸡肝脏FGF23基因的表达,显著上调FGF19基因的表达.关联分析结果显示,FGF19基因上存在5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,包括 rs17814792、rs17816980、rs17817557、rs17814446 和 rs17811770,除rs17814446外的4个变异位点均与固始鸡不同阶段产蛋数显著相关.[结论]FGF家族在肉鸡和蛋鸡品种形成中有重要贡献,各成员在脂质代谢相关器官中均有表达;FGF19基因在鸡产蛋高峰期肝脏表达量高于产蛋前期,且受雌激素正向调控,对鸡产蛋性能有重要影响.