免疫原性细胞死亡相关基因对膀胱癌预后分型及免疫治疗的影响

Journal of China Medical University(2023)

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摘要
目的 探讨免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因对膀胱癌(BC)预后及免疫治疗的影响.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取BC数据集,采用两独立样本Wilcoxon秩和检验比较BC中34个ICD相关基因的表达.基于ICD相关基因表达进行聚类分析,对2种ICD相关亚型进行基因本体(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)富集、体细胞突变差异和免疫细胞浸润差异分析.构建LASSO Cox回归风险预后模型,验证其临床应用价值.结果 ICD相关基因在BC和正常膀胱组织中表达有差异.2种ICD相关亚型的差异基因主要富集于T细胞激活、免疫球蛋白生成等生物学功能;参与T细胞激活、B细胞激活、T细胞活化的正向调节等信号通路.体细胞突变结果显示,ICD高评分组TP53突变频率更高,富含更多免疫细胞.利用7个ICD相关基因建立风险预后模型,该模型在不同临床特征中均有较好的预测价值.结论 ICD相关基因对BC患者的预后预测和免疫治疗指导有重要意义.
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