青海省果洛州、黄南州鼠疫菌CRISPR基因分型及其多态性分析

目的 了解青海省果洛、黄南州鼠疫菌CRISPR遗传多态性和地区分布特征,为该地区鼠疫防控工作提供科学依据.方法 采用常规方法对实验菌株进行DNA提取,利用PCR技术对设计的相应引物的CRISPR 3个位点YPa、YPb、YPc进行扩增、测序,通过软件工具CRISPR Finder和NCBI数据库,分析鉴定其间区序列,推测基因序列来源.结果 26株鼠疫菌在CRISPR 3个位点发现17种间区序列,分别为YPa9种、YPb5种、YPc 3种.所有试验用菌株可分为5种CRISPR基因型(G7、G22、G22-a1'、G24、G30),其中G22和G22-a1'为该地区主要基因型.结论 青海省果洛、黄南州鼠疫菌CRISPR基因遗传位点具有多态性,地理分布区域特征明显,为本地区建立鼠疫菌基因库提供基础数据.