Analysis on Molecular Mechanism of Duhuo Jisheng Decoction(独活寄生汤)in Treatment of Degenerative Lumbar Spinal Stenosis Based on Network Pharmacology and Molecular Dock
Liaoning Journal of Traditional Chinese Medicine(2023)
Abstract
目的 运用网络药理学的研究方法,初步分析独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症(DLSS)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索和筛选独活寄生汤方药物的活性成分,同时在GeneCards、OMIM数据库中检索DLSS的靶点.利用Venny平台得到独活寄生汤治疗DLSS的潜在作用靶点.利用STRING数据库和Cy-toscape软件构建独活寄生汤治疗DLSS的"单味药—活性成分—作用靶点"网络和蛋白质相互作用网络(PPI),并通过David数据库对独活寄生汤治疗DLSS的作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,研究独活寄生汤治疗DLSS的作用机制,并通过分子对接来模拟活性成分作用于靶蛋白的结合情况.结果 共探索出独活寄生汤主要涉及1939个有效活性成分及对应292个潜在靶点,DLSS靶点1258个,筛选出共同靶点122个.经PPI互作图显示蛋白ALB、AKT1、IL-6、IL-1B、CASP3等存在较多连线.药物-活性成分-靶点网络图显示,度值较高的活性成分主要涉及柚皮素、芒柄花黄素、甘草查尔酮A、黄芩素等,被影响较多的靶点为PTGS2、ESR1、HSP90AA1等.GO功能分析提示,关键靶点基因在生物过程(BP)主要参与了对氧化应激的反应、对脂多糖的反应、细胞对化学应激的反应等,在分子功能(MF)主要参与了脱氧核糖核酸-结合转录因子结合、信号受体激活剂活性、肽结合等,在细胞成分(CC)主要参与了膜筏、膜微区、囊腔等细胞结构,由此推测,治疗作用机制可能与信号转导蛋白、活性酶调节、炎症反应等有关.KEGG通路富集分析提示,关键通路主要涉及AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路.结论 借助网络药理学的研究方法,发现独活寄生汤治疗DLSS具有多靶点、多通路的特点,从抗炎、抗氧化、抗纤维化、抑制破骨细胞活性、促进成骨细胞活性等多个机制发挥治疗作用.
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