整合化学物质组学与网络药理学的四逆汤抗脓毒症"成分-靶点"相关性研究

Journal of Shenyang Pharmaceutical University(2023)

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摘要
目的 探讨四逆汤治疗脓毒症的活性成分、作用靶点及机制.方法 采用超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(UHPLC-Q-TOFMS)鉴定四逆汤的潜在活性成分,通过中药系统药理学数据库与分析平台和Swiss Target Prediction数据库预测其作用靶点,GeneCards、GisGeNET和comparative toxicogenomics database(CTD)数据库寻找脓毒症靶点,分别用String平台、Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白-蛋白相互作用、成分-靶点-通路网络,筛选活性成分和潜在靶点,借助DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)注释和基因组百科全书(kyotoencyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析,最后采用分子对接、表面等离子共振技术验证成分和靶点之间的结合能力与亲和力.结果 共鉴定出46种潜在活性成分、筛选到156个关键靶点;GO富集得到1 019个条目、151条通路,涉及癌症信号、脂质与动脉粥样硬化等;验证结果显示宋果灵、1-脱氢-8-姜酮、芒柄花黄素等成分与AKT1、TNF、TP53等关键靶点结合良好,宋果灵、芒柄花黄素与AKT的亲和力良好(Kd=4.424×10-4、2.218×10-4mol·-1).结论 初步探讨了四逆汤治疗脓毒症的作用机制,为进一步研究提供依据.
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