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基于mtDNA-C0Ⅰ基因的山东省淡色库蚊种群遗传多样性分析

Chinese Journal of Vector Biology and Control(2023)

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摘要
目的 探讨山东省淡色库蚊种群遗传多样性、遗传分化和系统发育关系.方法 从2020年9月—2022年9月,采集山东省菏泽、德州、聊城、青岛、烟台和日照共6个市的淡色库蚊.从单只雌性成蚊中分别提取基因组DNA,用PCR法扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(mtDNA-CO Ⅰ)基因序列并测序,获得的序列在GenBank上进行BLAST比对.应用BioEdit 7.0软件对测序结果比对分析;运用DnaSPv6软件分析种群的遗传多样性;采用Arlequin 3.5软件计算种群遗传分化系数和基因流;使用PopART 1.7软件构建单倍型网络图(TCS network法).结果 山东省6个淡色库蚊种群共获得423条序列,其长度均为603 bp.A+T平均含量占69.2%,符合线粒体DNA的AT偏向性.单倍型分析共获得8种单倍型,其中单倍型H01为优势单倍型.mtDNA-CO Ⅰ序列分析结果显示,种群具有丰富的遗传多样性;分子变异等级分析表明淡色库蚊遗传分化主要来自于种群内部;部分种群间存在一定的遗传分化现象.中性检验结果显示:聊城和菏泽淡色库蚊种群近期经历过扩张.结论 mtDNA-CO Ⅰ基因可以作为研究淡色库蚊种群遗传多样性的分子标志.青岛种群遗传发育与其他地理种群相比有一定特殊性.
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